香港大學化學系系主任陳冠華表示，港大的團隊也曾在理論上探討以納米碳管製作機械裝置，規模會比分子機器大一點，當時結論是理論上只要能用納米碳管製成震盪器和旋轉器，就可以作出所有機械運動，其中一個應用可能，是傳輸藥物進入人體，但離這一步還很遙遠，未有詳細探討如何做。
陳冠華表示，分子機器現時的發展仍處於基礎研究階段，很多是概念上證實可行，暫時看不到有很具體的應用前景，對於這範疇獲得今年諾貝爾獎感到有點驚訝，但同時感到開心，因為「自己也是做基礎研究」。

或發展成能量儲存裝置

理工大學應用生物及化學科技學系副教授黃文健認為，非常小的分子機器，發展潛力很大，估計20年後可能有應用。他指其中一個方向，是用分子機器以機械方式將氨基酸連結成蛋白質，用於醫療，因為用酵素連結氨基酸的化學方法，會涉及體內大範圍，機械方法則份量可以更小和可控制，會更有針對性。
他指分子機器往往有由光驅動的特質，亦可能發展成新的能量儲存裝置和感應器。分子機器將光能轉化成動能，但如果可將能量儲存在分子中和找到釋放方法，就是一種極微型儲能裝置。
同樣，分子機器感光移動，可用於測光的大小，研發分子級感應器，有可能配合其他分子機器，製作更複雜的分子機械人。
《蘋果》記者