近期多間基督教教會連番爆出性侵風波，天主教教區主教楊鳴章表示，教會是導人向善的「罪人團體」而非「聖人團體」，但每當他聽到這些醜聞時，都感到相當痛心。他形容這些醜聞會令「親者痛，仇者快」，意即討厭教會的人該十分開心，但教會中人則會十分傷心。

對於數間基督教教會處理受害人投訴的手法，楊稱自己並非基督教徒，故無權評論近期數宗個案的處理手法是否合適。但他表示就天主教香港教區而言，教區有既定機制處理這些投訴，當中包括邀請非神職人員等獨立人士參與處理，強調不會出現類似「警方查返警方」的情況，教區亦不會「姑息養奸」。他又稱，教區向來著重這方面的操守，以培訓神職人員為例，相關的教條會在培訓開首時便會說明得相當清楚，而每當出現性侵醜聞時，他們亦會視之為再次提醒神職人員及會眾要遵循相關教條的機會。

而早前關於他辭職的謠傳，楊再次澄清自己會擔任主教至75歲這教廷法定的退休年齡，並笑指自己身體十分健康，「做咁耐主教一日假都未請過」，相信自己不會因健康問題而提早退休。另外，近年中梵關係日漸回暖，他表示自己並非「中梵關係小組」的成員，故認為自己不宜多言。他只表示，任何國家的關係都不會如一潭死水般毫無變化。