出問題的是機長遺體。荷蘭專家檢驗後，認為遺體「早被人裏裏外外檢查過以清除異物」，但即使如此，遺體仍帶有「數以百計金屬碎片」。此外，空難後即時被拍照記錄的機身與貨物、駕駛艙的航空電子設備組件，以及帶有貫穿與焚燒痕迹的殘骸，亦一概不知所終。
做手腳的是誰？是否有人要隱瞞真相？報告拒絕猜測，就如拒絕指明肇難的導彈是由哪方發射一樣，但這個核心疑團，荷蘭安全委員會主席尤斯塔在發表報告後，私下跟部份傳媒透露指，「（導彈發射地區）是由親俄武裝控制」。
報告指客機遭至少800塊導彈碎片以時速4,500至9,000公里擊中，令駕駛艙撕裂後，巨響震耳欲聾、客機突減速再加速撞向地面、熱空氣的壓力波在數毫秒間貫穿機艙，「令部份乘客頭暈、惡心、失去知覺」。報告指不排除有乘客清醒，有人甚至被強氣流扯掉衣服，部份遺體赤裸。
英國《衞報》/法新社