關西機場人工島在颱風吹襲下水浸，工程師倪學仁指出，所有填海建造的人工島在設計時都會根據當地氣候數據作為參數，建造足以阻擋風浪的防波堤，一般標準是可以抵擋100年一遇的風浪。他指出，關西機場今次水浸，主要是氣候轉變令海浪高於海堤的設計抵禦能力。但目前仍要檢視破壞程度才可確定人工島設計是否有問題，如果連防波堤及弱波石都在颱風中受破壞，便可能需提高防波堤的設計標準。

倪學仁指出，關西機場面向太平洋，而本港赤鱲角機場與正興建的第三條跑道均背對太平洋，更有大嶼山遮擋，所以受到的風浪會較細。反而正研究的東大嶼都會人工島在位置上所受到風浪則會較大，在設計上有需要加強防波浪。工程上有很多方法，如加高填海高度，加建避風港等等，但成本亦會因此上升，填海而得土地地價會很高，令發展效益受影響。

本港機場管理局表示，同是人工島的赤鱲角機場於設計及建造時，已根據政府的相關標準及準則，充分考慮到機場附近的地理環境，以及可能因極端潮汐或其他惡劣情況出現水浸的風險。香港國際機場自1998年啟用至今，一直運作暢順。至於機場三跑道系統的設計，亦已考慮到聯合國屬下的政府間氣候變化專門委員會(Intergovernmental Panel on Climate Change) 於2014年就氣候變化及潛在海平面水位上升所提出的建議。

赤鱲角機場暫時安全，東大嶼建人工島卻似「難逃一劫」。近日填海和興建東大嶼都會再惹熱議，特首林鄭月娥早前更出口術表明填海是無可避免，多個團體，包括350香港、綠嶺行動、環保觸覺及香港海豚保育學會均對東大嶼都會及其他近岸填海工程有保留。其中環保觸覺等計劃發起網上聯署，呼籲市民反對計劃。環保觸覺義務總幹事譚凱邦指，日前關西機場因颱風而出現水浸及需封閉，反映人工島在面對極端天氣時有一定風險。

世界性關注氣候變化組織350.org的香港分部「350香港」聯合創辦人麥永開認為面對氣候變化，香港正就減少碳排放作出多方面的行動，但若在中部水域興建如此大型人工島，只會令二氧化碳排放量大增，完全將現時減碳的效果抵銷，而填海相對於其他供應選項，包括發展粉嶺高爾夫球場和修復棕地等，所釋放出的溫室氣體量將以數倍增加。該會又引用荷蘭一名大學教授於2012年的研究指，計算不同海平面上升對當地基建造價的影響，假如海平面上升24厘米至150厘米，相關工程造價會上升5.1倍。

該組成員、曾任天文台助理台長的理大土地測量及地理資訊學系客席教授梁榮武亦指，政府提出興建東大嶼都會的建議，未有充份評估氣候變化可能帶來的安全隱患，亦質疑在設計造價上未有就預防颱風、風暴潮和暴雨潮的衝擊作全面風險評估。他解釋，現時極端天氣出現得愈來愈頻密，日後50年一遇的大暴雨或可能變成一年一遇，若大量市民居於人工島上，而相信不少人亦會臨海而居，面對風暴的風險會大增。他舉例日本關西機場出現大型水浸，便時當年填海評估不足所致，未有考慮到今天的極端天氣變化，故若今日填出的東大嶼都會未有做足2、30年後面對更極端氣候時的影響，將面對無可挽救的後果。

350香港又指，按聯合國政府間氣候變化專門委員會2013年的報告指，若全球在沒有作出積極減排的情況下，推算本世紀末全球平均氣溫最高可上升4.8度，海平面可上升逾1米，梁榮武認為如水位上升，人工島面對的水浸風險更高，雖然可「填高啲」去應對，但相對的工程造價會更貴。

另外，香港海豚保育學會會長鄭家泰亦反對東大嶼都會和近岸填海建議，他指大嶼山北部原屬海豚和江豚的棲息地，但三跑工程令不少海豚遠離該處，當局原承諾在工程完結後加大海岸公園的面積令海豚返回棲息地，但若再在該水域進行小蠔灣等3項近岸填海工程，根本無法令海豚回歸。而東大嶼都會附近雖並非海豚棲息地，但中部水域南面在旱季時亦有不少江豚出沒，若進行大型填海工程一定對江豚構成影響。