1999年有報道指彭定康將出任歐盟貿易專員，但遭中方強烈反對。最後彭定康出任歐盟外交專員，他亦表態支持中國加入世貿。彭定康在任內多次與中國高層會面，雙方關係開始逆轉。2002年，彭定康應邀正式訪問北京，獲當時的國家主席江澤民於中南海以元首級規格接待，兩人握手言歡。
2003年起彭定康出任牛津大學校監，之後他曾經多次訪港，但他對香港問題顯得有所避忌，被傳媒追問，也只是作出簡短回應。中方對他的言論亦未見太大反應。今年3月他再度訪港，受到大群市民熱烈歡迎，有人更高舉港英旗。結果再引來中方炮轟，批評他「罔顧事實，顛倒黑白」。
今年7.1遊行後彭定康接受英國《金融時報》訪問，批評一國兩制白皮書損害香港高度自治。中方隨即回應，反對外部勢力插手香港內部事務。