陳日君表示，中方一直沒有禁止他到內地，但承認今次訪問是事先有人與當局溝通；他表示欣賞中央的善意，認為是溝通的好開始，但強調不能心急及一步登天。他認為，特區政府及中聯辦沒有將港人的想法向內地講解，令內地及港人出現不少誤會，希望北京當局可多聽港人的意見。

與姊同行返鄉拜祭
據了解，中方上月中主動邀請陳日君到上海，建議他看看上海的最新發展及重新認識祖國，陳日君初時猶豫不決，憂慮北上可能惹來不必要的政治風波，後來幾經對方強烈邀請，終同意於上星期成行。
梵蒂岡發言人則表示，知悉陳日君訪滬，暫時不會發表意見。陳日君是次故鄉之行，到過上海佘山聖母大殿及修道院，又與其姊拜祭姊夫。上海徐家匯天主教堂指陳主教到埗後，曾到醫院探訪抱恙的上海教區主教金魯賢。

「好難達統戰目的」
有教會人士表示，是次邀請陳到訪的金魯賢是當地公開教會的主教，地位僅次於北京教區主教、人大常委會副委員長傅鐵山，上海教區對宗教團體的態度一向被視為中央政府的「探熱針」；教會與中央均希望改善關係，但談不上中梵建交層面，此行象徵意義多於實際。
香港大學政治與公共行政學系副教授盧兆興指，中央這次是希望透過懷柔手段達統戰目的，從而減低宗教團體的政治動員能力，但他認為在目前政治氣氛下，北京與教區關係短期內難以緩和，「陳主教政治理念咁明確，北京好難達到統戰目的。」
陳日君自八九年起，每年均有半年時間在內地各修院服務，包括上海、武漢、西安等，但自九八年三月起便沒有再踏足內地，九九年欲再到訪時遭宗教局婉拒，這次亦是他擔任主教後首次踏足內地。他早前順利取得回鄉證。