據稱,兒童中心集中治療的奇難雜症不會太多;公立醫院會繼續提供急症、第二層及社區醫療。公院會將複雜病症轉介到兒童中心。現時每年有170宗兒童腫瘤科新症,日後兒童中心會接收所有腫瘤科新症,現時公院的兒童腫瘤科病人會轉介該中心。中心會治療罕見及需不同專科治療的病症,如血友病。每年300宗兒童心臟外科病人,日後也會集中在兒童中心處理,包括心導管介入手術等。公院繼續提供緊急病人評估等。
現時本港有50名兒童患末期腎衰竭,日後所有兒童腎科病床、換腎、急性及慢性血液透析及腹膜透析治療由兒童中心提供,公院提供其他腎科及泌尿科服務。除了病童太危急、運送會有危險外,日後所有腦神經外科手術在兒童中心處理。所有新生嬰兒手術及其後年齡兒童的高危手術也會由兒童中心提供。