貪污活動一般十分隱秘，並在授受皆悅的情況下進行，調查相當困難。為此廉署必須具備足夠的權力，才能有效執行職務，鏟除貪污分子。另一方面，為確保廉署人員不會濫用權力，廉署的運作也受到一套嚴謹的監察與制衡制度監管。

法例指定偵查貪污權力
廉署首席調查主任朱敏健指出，法例賦予廉署權力，在懷疑有人涉嫌觸犯貪污或相關條例時，可以進行逮捕，該權力與其他紀律部隊相似。至於搜查行動，則必須先向法庭申請搜查令才能進行；在緊急情況下，法例容許廉政專員簽發搜查令。
有些不法之徒利用迂迴手法清洗貪污得來的黑錢，期望瞞天過海，逍遙法外。為了揭發這類掩飾行藏，法例同時賦予廉署人員權力，查閱受疑人的銀行戶口資料及資產帳目。
廉署人員亦可向法庭申請，要求受疑人交代其資產來源及財務往來；如受疑人拒絕合作，則屬違法。