不過,多名議員都擔心計劃會令政府失去主導權,最終可能令發展商得到較滿意的補地價值。地政總署署長甯漢豪表示,協議定價仍然由地政總署提供,而且仲裁成員由申請者及地政總署雙方同意才可出任,不擔心會失去主導權。
民協立法會議員馮檢基認為,應相信公務員的中立性,認為政府毋須在補地價問題讓步,故不贊成將有關權力讓出。人民力量陳偉業則指,涉及補地價的金額龐大,延後利益可令測量師行有巨大利益。委員會最終通過由馮檢基提出並經何秀蘭修訂的動議,反對政府推出補地價仲裁先導計劃,防止貪腐滋生。在動議表決前,民建聯蔣麗芸曾提出中止待續有關項目但被否決。但動議沒有約束力,由於計劃不牽涉立法,計劃可如期進行。