阿蓋德旗下組織近年多次發放錄影、錄音,威脅採取針對中國的暴力行動。中國迄今並未受到直接來自阿蓋德組織的恐怖襲擊,但不容忽視的是,大批在海外旅遊、公幹的中國公民,成為恐怖襲擊目標的風險越來越大,北京要擴大國際反恐合作,就必須與國際社會的認知接軌。
將一般的民族糾紛、少數民族地區的一般暴力行為,都納入反恐範疇,只會引致歐美關注中國人權的組織的反彈,削弱反恐合作,同時也會刺激維族人的不滿。在北京的一些維族學者一再批評,新疆當局有將疆獨擴大化的嫌疑。新疆一些跟民族問題沒關的暴力活動,一旦跟維族人有關,就會被指為跟疆獨有關、跟境外有關,就會被歸入三種勢力,這種做法實際上加劇了新疆各民族之間的不信任和緊張關係,擴大了打擊面。