環保觸覺等多個環團表明，填海選址附近龍鼓灘、小蠔灣和欣澳一帶水域有中華白海豚出沒，政府未提供足夠數據說服未來人口增長對住屋的需求，加上龍鼓灘已有油庫、發電廠、煉鋼廠等厭惡性污染設施，未必適合居住，難以支持一個永久破壞海洋生態的造地方案。第二階段公眾諮詢至6月21日結束，其間會舉辦數場公開論壇收集意見，並會諮詢區議會。
政府表明，近岸填海造地方案最快可於2019年有首幅土地「面世」，又指填海成本較收地為低。不過，即使近岸填海及興建人工島合共可造地逾3,000公頃，當局初步未有估算可興建多少單位。政府指青衣西南大有機會興建10號貨櫃碼頭，小蠔灣則會發展物流園，欣澳則會成為娛樂及商業用地，意味最終只得龍鼓灘及馬料水可提供大量住宅土地，但至今仍未有詳細規劃用途。