按照獲批的政策，毗鄰港澳、佔地106.46平方公里的橫琴島相當於一個類似於香港的「自由貿易區」，從境外進入橫琴與生產有關的貨物實行備案管理，給予免稅或保稅，而設在橫琴的企業之間貨物交易將免徵增值稅和消費稅。
據透露，相關優惠政策涉及財政、稅收、產業、海關等多個方面。其中，最大的亮點就是相關部門申報的在橫琴新區實行「分線管理」創新通關模式已得到中央首肯。
這一通關模式將橫琴與澳門之間的口岸設定為「一線」管理，橫琴與內地之間設定為「二線」管理，按照「一線」放寬、「二線」管住、人貨分離、分類管理的原則實施分級管理。有關專家指出，有了這條優惠政策，橫琴新區就相當於一個類似於香港的「自由貿易區」。
橫琴產業佈局也得到明確。據了解，橫琴將允許建設商業性生活消費設施和開展商業零售等業務，重點發展旅遊休閒、商務服務、金融服務、文化創意、中醫保健、科教研發和高技術等產業。