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香港海上工程越來越多，海豚近年遷往南大嶼海域棲息，與高速船航道為鄰。世界自然基金會香港分會（WWF）在南大嶼海域進行首個全天候海底聲音研究，在海底放置錄音機一年，收集中華白海豚聲音、回聲定位訊號和船隻駛經的聲音。研究發現鯨豚在當地長期受船隻噪音影響，當高速船經過，海豚聽力範圍削減25%至45%，最嚴重削減逾8成。WWF促請政府改劃航道避開海豚棲息地，在南大嶼海域設立船隻限速區。

研究發現索罟群島是海豚主要棲息地，但海豚估計因為避開船隻，日間清晨6時至黃昏6時在分流棲息，要在凌晨3時至早上7時船隻較少時，才橫越航道進入索罟群島覓食和休息。水底聲音專家Matthew Pine博士指，海上交通和高速船阻礙海豚覓食及增加牠們的壓力。

Andreas Struck博士指，近年在香港海域航行的船隻和高速船越來越多，他經過電腦模型推算，建議在南大嶼和索罟群島之間航道設立限速區，限制最高15節航速，預料多用11.5分鐘時間。另一方法是將航道改在索罟群島以南，預料多花8分鐘時間和多行駛8.8公里。他建議避開夜晚有高速船行駛。