「天氣差怎讓他飛！」復興失事班機正機師李義良的女兒在父親遺像前哭紅雙眼（上圖），她無奈地發問︰「天氣這麼糟，全台灣都籠罩在暴風圈，氣流那麼不穩定，不曉得是誰讓他飛，不知該向誰討公道？」一同殉職的副機師江冠興的母親泣成不聲，「我還來不及坐他開的飛機」。專家質疑，雷擊與風切變的氣象條件，是導致空難的「兇手」。

不過，台灣民航局堅稱，事發前天氣情況符合飛行條件，航班失事前後，另兩架航班都安全降落，事故應屬飛行安全事故。副局長李萬里說，客機失事時能見度並非如外界所傳僅800米，而是1,600米。他認為，客機升降與否要由機師判斷，若前方有雷雨，繞過還是重飛，是否落地或返回起飛點，都要由機長自行判斷。他說，事故原因有待於專業單位鑑定，民航局不去揣測飛行員動作。
至於外界質疑航機偏離航道導致墜機，台灣飛安會執行長王興中說，班機上的兩個黑盒已找到，外部已扭曲變形，如順利最快一周可完成解讀。飛安會的調查需三個月才能完成。失事班機的製造方、法國航空調查機關也將派人協查失事原因。立法院交通委員會的朝野立委要求重新審查民航局的飛航起降標準。
台灣《蘋果日報》