據報，石岩水庫的年供水量2.8億立方米，主要為寶安區的100多萬人口提供食水；羅田水庫則為松崗和東莞大朗鎮牛陂村的10多萬居民供水。本月5日，省環保局發佈2007年第一季環境質量季報指，上述兩個水庫的水質並未達標，氨氮、糞大腸菌群、鐵、氟化物和總氮等超標。而市環保局則指，石岩水庫最近半年的水質中，有五個月的水質「很差」。
石岩水庫管理站負責人鍾思東稱，水庫上游是人口和工業密集的石岩，流入水庫的主要河道石岩河中，經常被人亂丟生活垃圾、傾倒生活污水，街道上亂丟的垃圾也會被大雨帶入水庫，令水庫受污染。
而羅田水庫因鄰近東莞大朗鎮水平村，該村在水庫上游的十多個養豬場，至少把一萬多頭豬的糞便等污水直接排入水庫，成了水庫最主要的污染源，經常可看到數百平方米的水面上泛着泡沫，泡沫下則漂浮着黑色的動物糞便，層層叠叠，傳出惡臭。由於污染問題涉及兩市，問題遂無法得到迅速或有效的解決。
廣東《南方都市報》