有官場中人指出，早在局署尚未合併年代，教育署已是出名作風保守、做事因循的部門，當年擔任教育改革大旗手、後來成為財政司司長的梁錦松，就曾經批評香港教育界有「三座大山」阻礙教改，分別是教協、教會辦學團體及教育署。政府後來推動校本管理對付教會辦學團體，以懷柔政策改善和教協關係，惟獨對那些保守教育官僚，從來未有大刀闊斧的改革，就算後來局署合併，將教署收入教育局之內，也不過是換個招牌，無論是思維、文化及辦事手法均未有改變。
若在以往教育政策十年如一日的年代，教育官僚因循作風還不至於出現大錯，但回歸後老董不斷改變教育政策，先提倡母語教學、校本管理、設立直資學校、推出三三四學制等，對只講求「達標」的教育官僚而言，自然難於適應，「總之學校肯做、交到差做到就算」，之後有甚麼問題、是否出現後遺症，一概「掃落地毯底」算數。
況且，由於所有改革也需要學校配合，官僚自然不想觸怒學校，特別是名校，於是可以不管就不管，可以不理就不理，結果出現今次直資混賬風波，「就係因為長期縱容啲名校，個個以為間學校係自己私人公司，結果出事」。
至於事件如何收科，單仁聽聞政府會先整治那四間被審計署深入調查的直資學校，因為立法會政府帳目委員會一定要政府交代情況，其他直資學校的管治問題，相信留待帳委會完成聆訊後遲一步再作檢討。