第三波武漢肺炎疫情爆發源頭仍然未明，《蘋果》連日追問衞生防護中心，有否到彬記粥麵美食、新發茶餐廳及港泰護老中心三大爆疫地點抽取環境樣本，中心傳染病處主任張竹君覆稱沒打算，因相信有源頭患者在處所內散播病毒而致，「係預料之內」。不過，有傳染病科醫生及化學工程師均認為，環境調查是理解疾病爆發的關鍵，中心只指示店舖清潔，猶如不調查罪案現場就洗走證據，違背科學求真精神；若病毒真如世衞所言有空氣傳播可能，港府就被自己蒙在鼓裏。

今年2月本港首兩個牽涉10人以上的本地群組爆發，即「打邊爐」及福慧精舍群組，衞生防護中心都曾派人到現場作環境調查及採樣，最後認為兩者源頭是來自大陸或病毒潛伏期曾到大陸的患者。之後的康美樓及亨泰樓群組，因為牽涉同座向單位患者，中心也有派員採集環境樣本了解傳播途徑。

不過，今年3月後，中心再沒有就所有群組爆發採集環境樣本，即使是牽涉103人的酒吧及樂隊群組，中心亦只到個別地方抽樣本。7月5日開始的第三波疫情，中心更不曾就任何群組爆發抽取環境樣本，包括彬記粥麵美食、新發茶餐廳及港泰護老中心三大地點。

張竹君於7月13日記者會表示：「因為我哋一開頭知道有個案時候，已經叫咗佢哋大清洗，跟住陸續發現個案，我哋就冇再去攞環境樣本，因為其實都相信係有人（患者），就自然有機會污染到環境，或者同其他人士接觸時就傳播。呢個都係我哋預料之內。」

感染及傳染病專科醫生曾祈殷認為，這波疫情遠比之前嚴峻，很多專家認為病毒已變種、傳染力大增，世衞日前更表示，武漢肺炎或有空氣傳播能力，港府應該先在三大地點抽取環境樣本，分析病毒可能傳播的距離及方式，之後才再安排大清洗，「而家就好似一個兇殺案現場，你乜都唔做，就洗晒現場所有證據」。他相信衞生防護中心因為不夠人手，所以無奈放棄需時較長的環境調查工作，但對於流行病學研究而言，絕不理想。

化學工程師李浩基指，一般而言，1比49稀釋漂白水能夠殺死武漢肺炎病毒的DNA及RNA，相信大清洗過後的店舖，再做環境調查的意義也不大。他認為，環境調查能夠讓與涉事地點間隔、用料相似的場所，及早作出相應措施防疫，「大家先學到嘢，如果唔係，下次疫情再殺到嚟，點預防？」他認為三大爆疫地點有巨大的流行病學參考價值，但政府欠缺科學求真的精神，令人失望。

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