他指大橋工程開展後,大嶼山東北水域成為中華白海豚重災區,海豚已在該區絕迹;大嶼山西北水域內的海豚數目亦下降。海岸公園的原意是在2016年提供棲息空間,吸引已離開的海豚重返該水域,但若海岸公園延遲設立,不但延長工程對水域的影響,亦減低海豚回來的誘因及機會。
在同一水域的機場第三跑道預料亦在2016至17年動工,洪指港珠澳大橋延誤將令水域失去歇息空檔,擔心兩項工程期甚至重叠,對生態造成雙重打擊,日後難以恢復。他又指早前在三跑的環評時已提出兩項工程帶來的累積性影響,「但機管局唔理我哋,環諮會又唔追問落去」。