連接金鐘及海怡半島的南港島線（東段）全長約7公里，沿線設海洋公園、黃竹坑和利東三個中途站，通車後，由海怡半島至金鐘只需10分鐘，比現時最多可快35分鐘。鐵路造價原本預算只需70億元，但過去幾年建築工程價格上升了55%，加上因應公眾的意見及技術需要而作出多項設計修訂，令造價上升至123億至126億元。
將油麻地站和黃埔連接的觀塘線延線，將在何文田及黃埔增設兩個新站，通車後，由黃埔至旺角只需約5分鐘，比現時快20分鐘。觀塘線延線原本預算成本約為42億元，因建築工程價格上升約30%，預計建造成本約增至53億至56億元。
政府發言人表示，由於兩條鐵路工程仍需微調，最終工程造價要到明年第一季才定案。政府已分別預留黃竹坑及前山谷道邨兩幅用地，讓港鐵發展上蓋物業，收益將補貼兩條鐵路的建造成本。政府會繼續謹慎監察工程的開支，確保政府對該項目的補助公道及合理。
立法會議員王國興表示，兩條鐵路成本增幅太離譜，不但要上蓋物業大幅補貼，更令人擔心將來會否影響票價，港鐵必須清楚交代成本增加的數據。