《香港01》早前刊出台獨樂隊閃靈主音兼時代力量立委林昶佐的專訪時，特別加注「編者按：香港01一貫立場是反對台獨」，引起爭議，香港記者協會曾就事件發聲明對做法表示憂慮。《香港01》今日發文反駁記協聲明，批評記協以道德判官的姿態越俎代疱（庖）作出不必要的指摘，斥記協沒有細閱文章內容，卻作出杞人憂天式評論是大驚小怪，更質疑記協干預《香港01》的編採自主。記協回應指公眾對事件有疑慮，是否杞人憂天自有公論。

《香港01》上周刊出一篇題為《台重金屬閃靈演前簽證未批 主音嘆斷港台人民感情》的報道時，特別以「編者按」方式表明該公司一貫立場是反對台獨，惹起社會爭議，記協曾發聲明對事件表示憂慮，黨媒《環球時報》則在其後發文力撐《香港01》，斥記協不管「反中」報道「暗中助獨」。

《香港01》今日於網頁發表聲明回應事件，指公司為倡議型媒體，會大膽說出自己的想法與觀點，在規劃新聞採訪時不會以立場先行，作繭自縛，強調記者專訪林昶佐時未有迴避敏感話題和扭曲受訪者言論，形容是「恰恰盡了責任、切切實實將事實呈現予受眾」。聲明批評記協以道德判官的姿態越俎代疱（庖）作出不必要的指摘，無視報道內容作出杞人憂天式評論，又質疑記協在作出批評時未能做到秉公持平，不時被質疑雙重標準，同時要求記協「律人先律己」，勿因狹隘視野而扭曲行業使命，扎實做好份內事。

記協主席楊健興接受《蘋果》查詢時指，記協的聲明主要針對《香港01》在報道中加入「編者按」表明立場一事，無意評論或指控新聞內容，認為《香港01》的回應是誤會了記協提出的憂慮，或是有理解的問題。對於被指控越俎代疱（庖）和杞人憂天，楊指不止新聞界，就連公眾對事件都有疑慮，是否杞人憂天自有公論。楊強調，記協尊重個別傳媒的立場和編採自主，並無針對個別媒體，會繼續以一貫的原則捍衛新聞自由，若《香港01》認為記協雙重標準，希望對方可提供具體情況作討論。