美國國務卿賴斯(CondoleezzaRice)昨晨首度開聲，高調批評台灣當局推動入聯公投是挑釁行為，「不必要地提高台海海峽的緊張氣氛」，引起台灣各界關注。總統陳水扁回應稱，他會持續不斷推動入聯公投，並有信心明年3月22日總統大選時會通過，他並反指大陸最近把台灣基隆等港口列為境內港口「是嚴重挑釁」。
民進黨總統候選人謝長廷稱，入聯公投不可能因為誰反對就停下，「民進黨沒這個權力，這也不是陳水扁可以停下來的。」對美台關係因此緊張，謝稱若他當選「會好好處理」。台外交部長黃志芳則對賴斯的講話感到遺憾。國民黨總統候選人馬英九則稱，台美關係「將面臨很大衝擊」，而且正往冰點方向發展。