台灣特偵組起訴前總統陳水扁，非法取走約二萬份國家文件，當中部分屬於機密文件，違反國家機密保護法。

由於涉及文件資料相當龐大，特偵組的訴書厚達三大冊，總頁數達1221頁，總字數更多達120多萬字。

此案從2008年起查辦，先後兩次搜索陳水扁辦公室，以及陳水扁曾被羈押的北所舍房，查扣共102箱文件。