城市大學公共及社會行政學系副教授成名認為，所謂「台灣幫」、篤信風水等指控流於表面化，事件實際反映應科院內深層管理不善問題，令科研人員心存不滿，該院董事局應深入了解，否則隨時令問題惡化影響機構運作。但他指港府委任的董事均屬「有頭有面」的大忙人，有多少時間投入處理應科院事務成疑，「佢哋可能連開董事會都冇時間，何況要監管運作？呢個問題唔解決，好難有一個理想嘅制衡機制。」
中文大學政治與行政學系高級導師蔡子強表示，港府高層應責成負責的部門加強監察應科院，「董事局嘅官方成員可以扮演更積極角色，唔好次次要出事後先追究。」他又指應科院是由前特首董建華催生的機構，改朝換代後不獲重視，當局亦疏於監管，「呢啲機構同民生冇乜關係，若非有醜聞，入面搞乜都唔會受人關注。」