施政報告提出的公共交通費補貼計劃不包括邨巴及紅色小巴，引起經營者與乘客不滿。有消息指政府計劃擴大補貼範圍，將邨巴及紅色小巴納入計劃，但交換條件是邨巴及紅色小巴票價須受政府監管。預計政府每年開支會因此增加幾億元。

施政報告提出公共交通費補貼計劃，市民每月公共交通費超過400元以上，超出金額都可獲25%資助，上限為300元。計劃包括港鐵、巴士、專線小巴、電車及渡輪，但不包邨巴與紅色小巴。邨巴與紅色小巴業界及乘客均不滿被歧視，運輸及房屋局長陳帆曾承諾會重新考慮。

now新聞引述消息報道，政府經初步研究後，傾向進一步擴大補貼範圍，將紅色小巴及村巴都納入計劃，前提是營辦商要接受政府一定程度的監管，以免計劃被濫用。而補貼計劃原本預計每年開支20億元，亦會增加幾億元。

運輸及房屋局發言人接受查詢時表示，建議原本不包括紅色小巴及邨巴是由於補貼計劃所涵蓋的公共交通服務票價須有一定預知性，政府亦須對其票價調整有一定的參與。由於有市民認為應該將紅色小巴及邨巴納入計劃，政府正小心考慮和研究。目標是爭取在2018年初就最後確定的方案向立法會申請撥款，並在立法會通過撥款後的一年內盡快落實計劃。

屯門區旅運巴士同業聯會主席葉崇堅表示，現時300多條邨巴線都由運輸署發出營運證，亦需每月向運輸署提交營運資料，並非不受監管。對於業界是否接受更多監管，以換取納入補貼計劃，要視乎貝體方案，大原則是與其他公共交通一視同仁，不應令營辦商營運成本上升。

公共小巴總商會主席凌志強表示，現時有10多條紅色小巴線行走固定路線，收費非「海鮮價」，亦裝了八達通，業界要求這些小巴線應納入補貼計劃，亦願接受監管。但其他「公海」小巴大多無裝八達通，難以加入計劃。