萬里與夫人邊濤在1940年結婚,兩人育有四子一女,其中長子萬伯翱是資深傳媒人、中國傳記文學學會會長,去年曾來香港為上市公司站台。次子萬仲翔則任一間國際投資公司的香港辦事處主任。他的孫女萬熒女(萬寶寶)則是著名的珠寶設計師及京港社交名媛。
邊濤20歲時與時任中共山東運西地委書記萬里結婚,中共建政後她到國家建材部任處長、辦公室主任,之後轉職北京市郵電局。1978年退休後定居北京中南海,她的菜田在中南海頗有名氣,有客人串門時她還會把蔬菜當禮物。晚年邊濤行動不便、有老人癡呆,2003年10月病逝,終年83歲。