立法會教育事務委員會昨就學術自由和院校自主問題舉行特別會議。浸大教育學系副教授潘玉琼認為，教資會已從回歸前的「中介人」角色，變質為「干預的監察者」。學聯則批評，目前教資會扣起院校10%撥款，待評審院校符合角色才發還，令院校不得不聽命於操控財政大權的政府，被指令教統局有渠道干預院校的學術自由。
本身是理工大學校董的立法會議員張超雄透露，去年校董會已通過將校董人數定為29人，怎料教統局知悉後直接指令理大管理層將人數減至25人。他指按一貫做法，教統局應透過教資會轉述意見，事件顯示教資會已被架空，「教統局赤裸到唔使再經教資會，可見佢只係傀儡。」
教育界議員張文光批評教資會是教統局的爪牙、喉舌、傳聲筒，反問：「佢甚至助紂（教統局高官）為虐，係咪應廢咗佢哋？」泛聯盟議員劉秀成質疑教資會應否存在。
行政會議成員查史美倫本月起接任教資會主席，在前主席林李翹如的8年任期內，教資會不斷受到指摘，其間發生港大鍾庭耀事件和近期的教院風波。