醫管局在08至09年度財政預算中提及撥款改善九龍東醫院聯網的服務，有將軍澳居民查詢：有否計劃擴建將軍澳醫院，加強區內服務？
醫管局答：其實有關擴建計劃已得到西貢區議員支持，擬於現時將軍澳醫院的B區停車場新建一座日間醫療服務大樓，樓高共11層，包括低層地下、地下、1樓至8樓，以及一層地庫停車場。大樓可容納現時院內設有的各個專科門診、日間手術中心、日間醫療中心、內窺鏡檢查部、中醫診所、健康資源中心等，及將來投入服務的日間精神科病房和磁力共振。
在新大樓落成及啓用後，日間服務設施將會轉移至新大樓。騰空的主座大樓設施將會改建為病房，以及擴充現時不足的設施，包括藥房、化驗室等。新增的病床預計有178張，以配合服務需求。

擴建計劃已預留設施發展新的服務包括磁力共振、產科和新生嬰兒深切治療服務、日間精神科服務、加護病房及急症觀察病房。而現有的服務會得到加強或擴充，以容納更大的服務量，例如，新的專科門診將設有更多的診症室和候診區；深切治療部的病床將會增加一倍；病理部會加強發展，以提升服務質量。