人造細胞 助揭開生命秘密

立場新聞 2016/03/29 19:16


生物學家成功製造出擁有最少基因組的人造細胞,基因醫學發展踏出重要一步。

我們所做的都相當重要,因為我們可由此更加清楚細胞的運作。令我們可以以此知識,更有效地設計應用在醫學上使用。——研究人員 Clyde Hutchison。

合成生物學家 Craig Venter 希望透過製造出含最少基因組細胞,找出所有生命都擁有的必要基因組 (essential gene)。必要基因組就如建築的根基,用作支撐著整個建築物。Venter 的研究隊伍認為,若能成功研發出最少基因組細胞,將可以幫助科學家了解到維持生命核心功能的基因,並以此方向了解改造基因,甚至乎將其重新設計,用於醫學、生物能源,甚或是對抗天災等的方法。

不是唯一組合

經過 20 年的努力,研究人員終成功製造出名為 JCVI-syn3.0 的細胞。 JCVI-syn3.0 只擁有 473 組基因,數量比起自然界的生殖道黴漿菌 (Mycoplasma genitalium) 還要少至少 50 組基因。人造細胞 JCVI-syn3.0 可以依賴培養皿中的養份生存、生長和繁殖,是現今擁有最少基因組的生物。

反復測試製作「最少基因組」

要從基因組人造細胞並不容易,他們將生殖道黴漿菌的基因逐一刪除測試,2010 年,他們終合成到第一個人造細胞—— JVCI-syn1.0。不過,syn1.0 只是復製細胞製作,而非真正「設計」,所以他們再埋頭研究,務求真正設計出真正的人工細胞。在設計過程中,Venter 隊伍曾製作了只有 431 個基因,稱為 M. mycoides 的人造細胞,可惜細胞因缺少必要基因,未能生存。
為了製作出最少基因組細胞,他們將 M. mycoides 的基因組拆開成 8 個不同的 DNA 組,再重新組合。在反復測試的過程中, Venter 可找出必要基因以及將多餘的基因刪除,令細胞可以生存的同時,也可以保持最少基因數目。

未知仍在 尚需研究

不過,成功研製出 JCVI-syn3.0 只是了解生命的第一步;在 473 個基因中,他們只知當中 3 份 2 基因的結構和功能,但對其餘 31% 的詳情仍是毫無頭緒。Venter 坦言:「我們成功將世上生物基因排序好,卻未知當中對生命最重要的 149 個基因卻一無所知!」他強調,雖然 JCVI-syn3.0 是現時擁有最少基因組細胞,但卻並不是唯一的最少基因組合。因為隨著環境變異,生物所需的基因亦有不同,必須基因組組合也會隨之改變。
研究不單可以令科學家更加了解生命基本要素,更有助應用於不同生物科技中。研究合作夥伴 Synthetic Genomics 的 Dan Gibson 指,研究的長遠目標將會是設計和製造出合成生物,令研究人員可在這類合成生物中加入不同功能,在工業、醫學甚或是生物能源等不同範疇應用。
報告:
Hutchison, C.A., Chuang, R. Y., Noskov, V.N., Assad-Garcia, N., Deerinck, T.J., Ellisman, M.H. ... & Venter, J.C. (2016). Design and synthesis of a minimal bacterial genome. Science, 351, 6280. DOI: 10.1126/science.aad6253
文/eh